В медицинском отделении размещены кабинеты специалистов (педиатр, невролог, детский психиатр, врач ФТО и ЛФК), а также процедурный кабинет, два изолятора для вирусной и кишечной инфекций.
Цель деятельности – создание интегрированной в образовательный процесс системы оздоровительных и лечебно-профилактических мероприятий, оказание всесторонней помощи обучающимся, воспитанникам в укреплении здоровья, развитии и социальной адаптации.
Кабинет ФТО оснащен 14 аппаратами различного спектра действия: «Полюс-101», «Алмаг-01», «АМО-АТОС-Э» – магнитотерапия, «Солнышко», «ОУФ 370/400-03» – лечение ультрафиолетовыми лучами, «Амплипульс-5БР» – электростимуляция, «ЭС-10-5» – лечебный сон, ингалятор медицинский компрессорный ультразвуковой – ингаляции, «Поток-БР» – электрофорез, «Матрикс» – лазерная терапия, «Искра-4» – лечение гальваническими тонами, «Лимфа» – пневмомассаж, «Цветоритм», «Амблио-2», а также оборудованием для водолечения и теплолечения.